Plusieurs sociétés de fromagerie confient à la fédération le bouclement annuel de leur comptabilité. Cette collaboration apporte des avantages aux deux partenaires : vérification par un organe neutre, conseil en matière de gestion et de fiscalité pour les sociétés et informations diverses pour la fédération en vue de formuler des recommandations pour les négociations concernant les conditions de vente de lait et de location, la rénovation et le regroupement des fromageries. La fédération offre un service complet : bouclement de la comptabilité, décompte TVA, établissement de la déclaration d’impôt et de la demande de remboursement de l’impôt anticipé, rapport détaillé sur la gestion de la société avec recommandations. Elle conseille les sociétés de fromagerie lors de rénovations et de regroupements en établissant des calculs de faisabilité, prépare les dossiers pour déposer les demandes d’aide auprès du Crédit d’investissement, du Fonds rural cantonal et des Améliorations foncières.